
Es una de las enfermedades más comunes. Fue detectada en 1973 atacando campos de cebolla en Arequipa, Moquegua y Tacna. También ha sido observada en La Molina y Chincha.
Pyrenochaeta terrestris (Hansen) : Gorenz, J.C. Walker & Larson

Es causada por un hongo nativo del suelo que produce pudriciones en la raíz.
La enfermedad es favorecida por altas temperaturas (24 ºC – 28ºC), e infecta a las plantas en cualquier estado de su período vegetativo. Se transmite por Bulbos y plántulas infectadas y persiste indefinidamente en el suelo.
Síntomas
Ataca el sistema radicular, las cuales se muestran plasmolizadas, arrugadas y con una coloración típica rosado intenso. El follaje muestra plantas débiles y achaparradas, con hojas cloróticas y/o amarillentas.

En presencia de bajas temperaturas, las plantas emiten nuevas raíces, se reanuda el crecimiento, las hojas vuelven a ser turgentes pero progresivamente vuelven a enfermar y mueren.
Este patógeno, no precisamente causa la muerte de la planta, pero reduce notablemente el tamaño de los bulbos, resultando en simples porrones o bulbos pequeños, reduciendo los rendimientos.
Control
Emplear la modalidad de trasplantes, la mayoría de los cultivares que se siembran en Arequipa, no muestran daño de consideración debido al uso de este sistema de siembra.
Los cultivares blancos tienen mejor comportamiento de resistencia que los rojos. Las variedades Red creole, Yellow, Granex y Texas yellow, son resistentes.
Rotar con cultivos no hospederos como los granos, lo cual ayuda a disminuir la incidencia.